三代目ＦＪの特徴は、フロントカウルの大型化とフロント周りの一新です。

カウルは、ウインカーがビルトインされているナックルカウル部分の張り出しが大きくなり、スクリーンも立ち上がったスタイルに、カウルが一回り大型化したことで、ウインドプロテクション性能が向上しています。

前後ホイールが中空３本スポークタイプになり、フロントホイールが１６インチから１７インチに変更、タイヤ幅は変更なしですが、７０扁平のタイヤ採用によりホイールのリム幅が、これまでの２．７５インチから３インチに変更されました。
リヤのタイヤ、ホイールサイズは変更なし。

フロントブレーキは、298mmφフローティングローター＋対向４ポットキャリパーに強化、後輪ブレーキは従来のベンチレーテッドディスク＋対向２ポットキャリパーのままである。
このことから、大きなディスクローターを使うための１７インチホイール採用だったのでは？と想像しています。
１７インチ化したとはいえ、120/80-16と120/70-17のタイヤ外径寸法はほとんど差が無いからです。

フロントフォークのアンチノーズダイブ機構は外されましたが、プロリード、伸び側ダンパー調整が可能なプログラマブル・サスは継承されており、リアショックも同様。

エンジン関係では、高速度域の信頼性向上のために、キャブレターへの燃料供給方法が負圧コックによる自然落下式から電磁ポンプによる圧送式に変わりました。

あと細かい変更点は、チョークノブ上部のカウル（燃料タンク左側）内に小物入れの装備、カウル横のエアダクト部のプロテクターの形状が上下別体型から、横長の１本ベルト形状に変更、テールカウルのフィンがブラックアウトから、ボディーカラーと同色塗装に改められています。